Ο ηλιακός θερμοσίφωνας κατά την λειτουργία του εκμεταλλεύεται το φυσικό φαινόμενο της ροής των ρευστών λόγω διαφοράς θερμοκρασίας (διαφοράς πυκνότητας), γνωστό και σαν αρχή του θερμοσιφώνου. Έτσι έχουμε με φυσικό τρόπο συνεχής ροή του θερμαινόμενου μέσου, από το θερμότερο σημείο (ηλιακοί συλλέκτες) προς το ψυχρότερο (δεξαμενή νερού), μέχρις ότου τα δύο σημεία να αποκτήσουν παρόμοιες θερμοκρασίες. Για να είναι αυτό δυνατό πρέπει το ψυχρότερο σημείο να είναι ψηλότερα από το θερμότερο σημείο και για τον λόγο αυτό σε όλους τους ηλιακούς θερμοσίφωνες η δεξαμενή αποθήκευσης είναι πάντα ψηλότερα από τους ηλιακούς συλλέκτες.
Έτσι λοιπόν και στη δική σου περίπτωση για να έχουμε φυσική ανακυκλοφορία πρέπει οι συλλέκτες να είναι χαμηλότερα του μποίλερ, καθώς και οι σωληνώσεις να έχουν πορεία συνεχή ανοδική από συλλέκτη σε μποίλερ. Αν τα πετύχεις αυτά, μονώσεις επαρκώς τις σωληνώσεις και εξαερώσεις το κύκλωμα δεν βλέπω τον λόγο να μη δουλέψει.
Απαραίτητα θα πρέπει να βάλεις και ένα ασφαλιστικό στο σύστημά σου, καλού κακού.